山东北临渤海，南接黄海，拥有3000多公里的海岸线和众多港湾，更有东平湖、微山湖和京杭大运河、胶莱运河等内水资源，其辽阔的海域和内陆水域保存着丰富的水下文化遗产。资料显示，早在1979年，青岛市博物馆就组织潜水员在琅琊台鸭岛附近打捞了30余件明代青花瓷。随后，在我国水下考古事业刚刚起步之际，1989年至1990年国家举办的第一期水下考古培训班设在了青岛，国家水下文化遗产保护青岛基地也于2010年设立。

　　多年来，水下考古人员对山东沿海进行了多次水下文化遗产的调查、发掘工作。1991年、1992年和1998年，中国国家博物馆先后组织山东、福建等地水下考古专业人员分3次对烟台长岛县境内的各个岛屿进行重点调查，在小黑山岛附近海域发现了汉代遗物，在庙岛西海塘等地发现了宋、元、明、清时期水下文物和数片岳石文化、龙山文化陶片。2000年至2008年，中国国家博物馆水下考古中心又先后对青岛的胶南市琅琊台海域、黄岛区薛家岛海域宋金海战遗址等进行了调查，并结合第四期水下考古培训班实习，对琅琊台鸭岛沉船遗址进行了发掘。

　　2012年9月5日，大运河济宁段湖中运道水下考古正式启动。由中国国家博物馆、山东博物馆等单位的12名考古队员组成的考古队，对当时已被列为大运河申遗点的微山南阳湖中运道及其现存的利建闸进行物理扫描探测和水下考古勘察，理清湖中运道与新运河的关系、两岸的岸形结构等，为微山南阳湖运道申遗提供更加详实的实物资料。

　　“这是国内第一次开展运河水下文化遗产调查工作，不仅有助于为大运河水下遗产提供基础性资料，进一步进行系统记录和深入研究，更是推进水下考古工作的一次有益探索。”山东省文物局局长谢治秀表示。

　　2015年6月，山东省水下考古研究中心正式揭牌。中心为山东省文物局所属处级公益一类事业单位，也是全国首家省级水下考古专业研究机构，设办公室、水下考古研究室、技术与装备室、出水文物修复室4个科室，主要承担全省水下文物的调查、保护、发掘和研究工作。

　　近年来，水下文化遗产成为文化遗产保护领域新的热点，同时也成为犯罪分子觊觎的新目标，盗捞和破坏水下文物的违法犯罪活动猖獗，非法围填海、滥采海砂、随意倾倒废弃物以及在水下文物埋藏区周边非法建设、生产经营等行为时有发生，严重威胁了水下文化遗产安全。“水下文化遗产保护是一个涉及多学科、多部门的行业，工作非常繁重。山东水下考古力量薄弱、相对分散，跨区域作业、跨部门协调难度较大，亟须整合力量，强化水下文化遗产保护工作。”山东省文物局大遗址保护与考古处处长王守功说。